В Сальвадоре – разнообразный и увлекательный выбор предложений для активного отдыха. Традиционно популярны у экотуристов мангровые болота Баха-де-Икилиско, острова залива Гольфо-де-Фонсека - Сактильо, Мартин-Перес, Кончагита, Меангуэра, Тортуга, Мадре-Сол, Ло-Седрос и Сан-Себастьян - предлагают хороши условия для прогулок на яхтах, лодках и катерах, здесь регулярно появляются стаи дельфинов и китов, а на черном песке берегов залива нежатся на солнце морские черепахи. Бурные воды рек Лемпа, Пас и Торол удобны для рафтинга и сплава на каяках и байдарках.

Национальные парки Сальвадора, хоть и немногочисленны, но по-своему привлекательны. В этих необычных древних массивах охраняется знаменитый "облачный лес", в котором дубы и деревья лавра вырастают выше 30 метров, а их листья формируют зелёный навес, непроницаемый даже для яркого солнечного света. Разнообразные папоротники, орхидеи, грибы и мхи покрывают "этажи" леса. Местная фауна включает редких и охраняемых обезьян-пауков, муравьедов, пум, туканов, полосатых сов и других эндемиков. Главная жемчужина экосистемы Сальвадора - парк Серро-Верде, который имеет два уникальных природных объекта: первый - все еще активный и внушительный вулкан Исалько, заслуживший репутацию "маяка Tихого океана" за свой постоянно активный кратер, свечение которого даже днём видно за много километров. Второе "чудо" парка - синее вулканическое кратерное озеро Лаго-де-Коатепек на восточном склоне близлежащего вулкана. Парк Боске-эль-Импосибле имеет три климатические зоны в пределах Кордильера-де-Апанека, в нём насчитывается более 400 видов деревьев и около 1600 видов растений, некоторые из которых поистине уникальны. Буйная растительность предлагает убежище для многочисленных животных и птиц, среди которых: редкий черный орёл, трогон, изумрудный тукан, а также звездопад из колибри и 500 видов бабочек. Непосредственно за городом Метапан начинается зона Международного лесного заповедника Боске-Монтекристо, управляемого правительствами Сальвадора, Гондураса и Гватемалы. Территория заповедника тоже охватывает несколько климатических зон вдоль хребта Серро-Монтекристо, в высшей точке которого (2418 м) сходятся границы этих трех государств. Верхняя часть заповедника (2100 м и выше) занята девственными дождевыми лесами - здесь в среднем выпадает до 2000 мм осадков, а влажность воздуха близка к стопроцентной круглый год. Орхидеи, огромные дубы, сосны и кипарисы, обвитые лианами, лишайниками и мхами, формируют плотный навес, под которым день и ночь превращаются в одно целое.